[새 자연철학] 『생명을 어떻게 이해할까?』 1장, 2장

르구인

“ 슈뢰딩거의 이러한 문제의식과 관련하여 여기서 생각하고 넘어가야 할 한 가지 중요한 사항이 있다. 슈뢰딩거가 앞에서 강조하듯이 비생명적 현상에 비해 생명적 현상이 지닌 근본적인 차이점이 과연 있는지, 있다면 그것은 어디에서 나타나는지에 관한 이야기이다. 이는 근본적으로 생명이란 무엇인가 하는 문제와 직결된다. 간단히 결론만 이야기한다면, 첫째로 생명체 및 이것의 활동을 가능하 게 만드는 모든 물리적 여건만 갖추어진다면 그 안에는 이른바 비생명 현상에 적용되는 물리법칙 이외에 어떤 다른 것도 생각할 필요가 없다는 것이며, 둘째로는 이때 갖추어야 할 물리적 여건은 매우 광범위하면서도 매우 특수하다는 사실이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.28, 장회익 지음

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르구인

“ 슈뢰딩거가 말하는 '기막히게 잘 정돈된 일군의 원자들을 기준으로 이야기한다면, 이것 자체의 어떤 특별한 성격과 여기에 작용하는 어떤 '선도 원리'에 의해 생명 현상이 나타나는 것이 아니라, 이 기막히게 잘 정돈된 일군의 원자들과 이것과 '기막히게 잘 부합하는 주변의 물리적 여건’이 매우 놀라운 상호 부합 관계를 이루기 때문이다. 여기서 앞의 것을 ‘작용체’라 부르고 뒤의 것을 이에 대한 ‘보작용자’라 부른다면, 생명이란 작용체와 보작용자 사이의 정합적 관계를 통해 나타나는 현상이라 할 수 있다. … 생명을 이해하기 위해 ‘작용체’와 이것이 함축하고 있는 ‘선도 원리’를 찾으려 할 것이 아니라 ‘작용체’와’와 그 ‘보작용자’, 그리고 이들 사이의 관계를 찾아보는 것이 중요 … ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.28-29, 장회익 지음

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르구인

“ 그렇다면 슈뢰딩거는 자신이 던진 질문, 즉 생명이란 무엇인가?에 대해 어떠한 대답을 하는가? 슈뢰딩거의 책이 출간된 지 60여 년이 지난 2008년 정확히 동일한 제목의 책을 낸 에드 레기스Ed Regis는 슈뢰딩거의 책이 지닌 결함을 지적하면서 다음과 같이 말한다. “그러나 이 모든 명료성과 간결성, 그리고 놀라운 예견력에도 불구하고 슈뢰딩거의 책은 몇 가지 약점을 가지고 있다. 그 하나는 책 제목으로 주어진 물음, 생명이란 무엇인가?에 대해 대답하지 않았고, 심지어 대답하려는 시도조차 하지 않았다는 점이다. 이 제목은 단지 겉에 내세운 영리한 마케팅 전략이었을까? 아니면 그 해답이 슈뢰딩거에게조차 너무 신비로운 것이었기 때문일까? 그는 여기에 대해 말이 없다.” ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.30, 장회익 지음

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르구인

“ 그러면 이것은 슈뢰딩거의 단순한 실수에서 비롯된 것인가? 그렇게 보기 어렵다. 이 안에는 살아 있는 것'에 대한 어떤 깊은 선입감이 잠재되어 있기 때문이라고 보는 것이 옳다. 그렇다면 그 선입감은 무엇일까? 어떤 생명체든 그 안에 '살아 있음'이라고 하는, 다른 말로 '생명'이라는 어떤 고유한 속성을 지니고 있다는 생각이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.31, 장회익 지음

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르구인

“ 슈뢰딩거는 이러한 상식선에서 분명히 생명이라 할 어떤 실체가 있는 것으로 일단 인정하고, 이것이 어떤 물리적 성질을 가지고 있느냐에 초점을 맞춘다. … 그러면서 도달하는 가장 중요한 결론은 생명체라는 것이 내적 질서, 곧 낮은 엔트로피 상태를 유지하고 있으며, 열역학 제2법칙에 따라 이것이 가능하려면 이 생명체는 불가피하게 외부로부터 부-엔트로피negative entropy를 받아들여야 한다는 것이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.32, 장회익 지음

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르구인

“ 슈뢰딩거의 이 말은 생명의 이해를 위한 핵심 내용을 담고 있지만, 아직까지도 많은 사람들이 여기에 충분한 관심을 기울이지 못하고 있다. 슈뢰딩거 또한 이를 언급해놓고도 더 이상 깊이 있는 논의를 진척시키지 않았다. … 오늘의 관점에서 아쉬운 점 두 가지만 지적한다면, 첫째로 슈뢰딩거의 추측과 달리 생명 현상은 정상적인 물리학만으로 이해 할 수 있게 되었다는 점이며, 둘째로 DNA 분자들의 기능은 오히려 매우 수동적이며 생명의 주된 활동은 DNA 분자와 세포의 나머지 부분 사이의 긴밀한 협동을 통해 이루어진다는 점이다. … 결론적으로 '살아 있음'을 나타내주는 내적 특성이 따로 있는 게 아니라 내부 구조와 외부 상 황의 적절한 관계 맺음이 그 본질적 내용을 구성한다는 것이다. 그런데도 우리 사회에서는, 그리고 학자들 사이에서도 여전히 생명체 안에는 생명을 이루는 어떤 결정적인 핵심 부분이 있으며, 이것이 바로 DNA 분자들로 구성된 유전자일 것이라는 생각이 계속 위력을 떨치고 있다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.33, 장회익 지음

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르구인

요즘도 DNA 중심으로 연구가 되고 있는 건지 찾아보니, DNA만 들여다보는 시대는 조금씩 지나가고 있는 것 같습니다. 여전히 DNA 연구가 가장 많이 이루어지는 것은 맞지만, RNA/전사체, 단백질체, 멀티오믹스 분야의 (소위) 성장속도가 더 빠른가 봅니다. '오믹스(omics)'는, DNA뿐 아니라 RNA·단백질·대사산물까지 세포 안에서 일어나는 일을 통째로 보려는 연구 분야라고 합니다. 생명체의 구성 성분 중 특정 부분을 하나의 집단으로 묶어서 통합적으로 분석하는 학문을, 전체를 뜻하는 접미사 ‘-ome’과 학문을 뜻하는 ‘-ics’를 결합한 말이고요. https://en.wikipedia.org/wiki/Omics https://en.wikipedia.org/wiki/Multiomics 유전체학 (Genomics), 전사체학 (Transcriptomics), 단백질체학 (Proteomics), 대사체학 (Metabolomics), 이런 분야가 있고, 여러 오믹스를 동시에 통합 분석하는 방법론을 멀티오믹스라고 하네요.

르구인

『생명을 어떻게 이해할까?』 (1) - 1장, 2장 읽기, 2주차가 시작되었습니다. • 3월 24일 (화) ~ 3월 30일 (월) : 1-3, 1-4, 1-5 1-3. 도킨스의 책 『이기적 유전자』 1-4. DNA 분자는 정보를 담고 있는가? 1-5. 생명은 어디에 들어있는가? 이제 본격적으로 DNA이야기로 들어갑니다. 도킨스는 왜 ‘유전자’ 앞에 ‘이기적’이라는 말을 붙였는지 이번에 제대로 알아봐야겠다는 생각이 듭니다. 수식을 받는 ‘유전자’가 ‘이기적’이라는 표현은 과학적으로 성립하지 않는 말인데, 왜 그렇게 이 책과 도킨스의 이야기가 대히트를 쳤는지 궁금합니다. 단지 흥행을 위한 제목이라고 하기에는 더 설명이 필요할 것 같습니다. 그리고 1-4절, ‘DNA 분자는 정보를 담고 있는가?’라는 제목에 주목해보면 좋겠습니다. 당연히 정보를 담고 있다고 생각하고 있는데, 이 질문은 어떻게 답을 풀어나갈까 궁금합니다. ‘생명은 정보인가?’라는 질문이 이번 주 읽을 부분에 포함돼 있는 것 같습니다. 이 질문을 생각하면서 읽어나가 보면 좋겠습니다.

꽃의요정

근데 이 작가님은 '이기적 유전자'를 도킨스가 유전자에만 너무 집중한 것처럼 묘사하시는데, 저는 그렇게 안 읽었거든요. 제목 때문에 그런 책이라고 생각하시는 분들도 계시겠지만, 도킨스도 유전적이지 않은 부분이 변수로 작용할 수 있다는 이야기를 책에 전반적으로 했던 걸로 기억합니다. 근데 제가 잘못 읽을 걸 수도 있습니다 ^^;;

르구인

아, 그러셨군요. 저는 아직 『이기적 유전자』를 읽기 전입니다. ^^; 궁금하기는 한데, 제가 즐겨 읽는 책의 저자들이 모두 비판적으로 보는데다 시간도 부족해서 계속 순위에서 밀리네요. 직접 읽으면 또 어떨지 모르겠습니다. 언젠가 '아직도 『이기적 유전자』 읽지 않은 사람들의 모임'을 만들어보고 싶네요. '이기적 유전자' 자리에 여러 현대 고전들을 넣으면 재밌는 모임이 될 것 같기도 합니다. ㅎㅎ

꽃의요정

다 이해한 건 아니라 나중에 몇 번 더 읽어야 할 거 같은데요. 생각보다 어렵지 않고 재미있었어요! ^^

르구인

“ 유전자의 역할에 대한 과장, 그리고 이에 따른 잘못된 인식은 도킨스만의 것이 아니다. 이것은 ‘현대 생물학을 통해 생명을 이해하는’ 사람들이 범하는 만연된 잘못이다. … … 여기서 덜 상대적으로 덜 강조되었던 점은 DNA 분자 안에 각인된 염기 서열 못지 않게 이것이 놓이는 세포 안의 물리적 여건과 이 세포가 놓인 주변 여건의 중요성이다. 많은 사람들은 DNA 분자가 지닌 정보적 측면에 지나치게 매료된 나머지, 이것이 정보로서의 기능을 나타내기 위한 상보적 여건에 대해서는 충분히 주의를 기울이지 못했던 것이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.38-39, 장회익 지음

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르구인

“ 생명의 본질이라는 것은 도대체 무엇을 말하는가? 이것이 바로 이 책 전체를 통해 추구할 내용이지만, 우선 이 맥락에서 이야기하자면 유전자와 함께 이를 둘러싸고 있는 주변의 여건이 유전자 못지않게 중요하다는 사실이다. … 마치 상자가 구슬을 담고 있듯이 DNA 분자가 정보를 담고 있는 것으로 생각할 수 있으나, 그렇지 않다. … 우리는 DNA 분자가 무엇으로 구성되어 있는지, 그리고 그 구성 요소 하나하나는 무엇인지 거의 완벽하게 이해하고 있다. 그런데 이러한 시각을 통해 DNA 분자가 생명 또는 정보로서의 어떤 성격을 가졌다는 이야기는 전혀 할 수 없는 것이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.40-41, 장회익 지음

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르구인

“ 그렇다면 DNA 분자가 정보를 지녔다는 말은 어떻게 할 수 있을까? 이것이 특정한 성격의 세포 안에 놓일 때에 한해 그러한 말을 할 수 있다. 즉, 정보라는 것은 DNA 분자 안에 있는 것이 아니라 DNA 부낮와 세포의 나머지 부분이 만날 때 비로고 우리가 정보라고 부르는 성격이 나타나는 것이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.41, 장회익 지음

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르구인

“ 우리가 DNA 분자 밖에 놓인 이러한 여건들의 중요성을 이해하기 위해서는 DNA 분자가 이런바 ‘죽은 세포 안에서는 아무런 기능도 하지 못한다는 사실만 생각해보면 된다. … 생명의 본질적 특성은 이를 구성하는 각각의 성분 속에서 찾을 것이 아니라 이들이 함께하는 만남 속에서 찾아야 한다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.42, 장회익 지음

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르구인

DNA가 정보를 '담는' 것이 아니라 만남 속에서 정보가 '나타난다'면, 우리가 일상적으로 쓰는 정보·지식·기억이라는 개념도 같은 방식으로 다시 봐야 할지 궁금하네요. 도킨스의 '이기적 유전자'라는 말이 과학적으로 부정확한 말임에도 불구에도 대히트를 친 이유가 무엇일까요? 우리가 '본능적으로'(?) 협동보다 경쟁의 서사에 더 끌리기 때문일까요?

르구인

“ 그렇다면 세포 안에서 유전자를 복사해내는 인쇄공은 누구인가? 대체로 말하면 세포 안의 나머지 부분이다. 더 정확히는 세포의 이 나머지 부분과 DNA 분자의 협동적인 작업이다. 이때 DNA 분자의 활동은 상대적으로 미약하여 거의 수동적으로 자신의 몸을 내맡기는 정도라 할 수 있다. … 이러한 점에서 유전자의 성격을 ‘자체촉매적’(autocatalytic)이라고 부르는 것이 훨씬 더 적절하다. DNA 분자로서는 자신의 존재 자체가 자신과 동일한 존재를 형성하는 과정에서 촉매적 기능을 하기 때문이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.43, 장회익 지음

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르구인

“ 이러한 상황에서 굳이 ‘자기 복제’라는 말을 쓰는 것은 암암리에 생명 활동의 주체를 유전자로 보는 현행 생물학계의 만연된 편견이 작용한 결과라고 할 수 있다. … 설혹 유전자가 능동적인 역할을 하고 있고 그 안에 성품이라 불릴 어떤 것을 감추고 있다고 보더라도, 여전히 ‘이기적’ 유전자라는 표현은 매우 잘못된 것이다. 유전자가 하는 행위는 오히려 놀랄 만큼 ‘협동적’이기 때문이다. … 이러한 협동의 결정적 증거는 유전자들이 단독 또는 소수로 존재할 수 없고 수천 또는 수만 종이 함께 존속해간다는 사실에서도 잘 드러난다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.44-45, 장회익 지음

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르구인

“ ‘생명이란 무엇인가?’라는 주제를 내걸고 진지한 해답을 추구하는 마굴리스와 (도리언) 세이건은 다음과 같이 말한다. “살아가는 존재들은 물과 탄소,수소 등에 대한 요구에 따르는 모습에서 보듯이 무도덕이며 기회포착적이다. 그들은 긴 역사를 통해 물질과 에너지와 정보로 구성되는 구조를 프랙털적으로 반복하고 있다.” ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.45, 장회익 지음

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르구인

“ 생명체를 구성하는 기본적인 정보가 DNA라는 분자 속에 들어 있다는 유명한 발견이 있은 후 많은 사람들은 우리가 드디어 생명의 정체를 밝혀냈다고 생각했다. 그러나 이 위대힌 발견이 기여한 가장 큰 공적은 생명의 정수라고 할 만한 그 어떤 것도 유전자 안에 들어 있지 않다는 사실을 보여주었다는 것이다. ”

『생명을 어떻게 이해할까? - 생명의 바른 모습, 물리학의 눈으로 보다』 p.46, 장회익 지음

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